Spacer
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Unterschiedlichste Spacer können in Oligonucleotide eingebaut werden, sowohl am 3'- als auch am 5'-Ende, oder auch intern in die Nucleotidkette. Die Spacer auf Ethylenglycol-Basis (Spacer18 = Hexaethylenglycol, HEG,
Spacer12 = Tetraethylenglycol und Spacer9 = Triethylenglycol) sind dabei etwas hydrophiler als die reinen Alkylketten (Spacer C3, Spacer C6 und Spacer C12).
Ein Spacer C3 am 3'-Ende eines Oligos verhindert die Kettenverlängerung während der PCR.
Beim dSpacer, der auch als abasic site, Tetrahydrofuran (THF) oder auch als apurinic/apyrimidinic (AP) site bezeichnet wird, handelt es sich um einen Desoxyribose-Baustein ohne Nucleobase, d.h. die Abstandsverhältnisse in der Oligonucleotidkette bleiben weitgehend unverändert.
Bei biomers.net erhalten Sie verschiedene terminale und interne Spacer:
- Spacer C3, Spacer C6, Spacer C12
- Spacer9, Spacer12, Spacer18
- dSpacer
| Modifikation | 5´ | 3´ | intern |
|---|---|---|---|
| Spacer C3 | x | x | x |
| Spacer C6 | x | x | x |
| Spacer C12 | x | x | x |
| Spacer9 | x | x | x |
| Spacer12 | x | x | x |
| Spacer18 | x | x | x |
| dSpacer | x | - | x |
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